Édesapja
Weltler János evangélikus kántortanító,
édesanyja
Zechmeister Anna volt. Már ötéves korába zongorázott, hat éves korában orgonált és néha már szülőfalujában az
istentiszteleteken is közreműködött. Az elemi iskolát szülőfalujában végezete, középiskolába
Győrbe járt, itt kezdte zeneiskolai
tanulmányait is.
Budapesten, a Zeneakadémián tanárai közül
Zalánfy Aladár gyakorolta rá a
legmélyebb hatást. 1932-ben kezdte meg kántori szolgálatát a kelenföldi gyülekezetben. 1942-ben került a Deák-téri gyülekezethez és lett a Lutheránia Énekkar
vezető karnagya is. Ezt a tisztségét több mint 45 éven keresztül töltötte be. Itt átlagban évi 15 művet tanultak meg, és irányításával a kórus igazi közösségé vált.
Az énekkar vezényletével négy úgynevezett nagy koncertet adott, ebből kettő karácsonyra illetve húsvétra esett. A vallásos művek előadása, amelyen neves művészek
működtek közre, zsúfolásig megtöltötte a Deák-téri evangélikus templomot. A repertoár gerincét Johann Sebastian Bach művei adták, de kortárs szerzők műveit is
előadták. 1984. február 10-én a Teológiai Akadémia ünnepélyes körülmények között, sok évtizedes egyházzenei szolgálatáért tiszteletbeli teológiai doktori címmel
tüntette ki Weltler Jenőt. Élete utolsó hónapjait a Kerepestarcsai Idősotthonban töltötte, és még akkor is, ott is ellátta a kántori szolgálatot.
